Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PDCD1Q15116 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PDCD1Q15116 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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