Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BRD3Q15059 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms