Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NWD1Q149M9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
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