Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPNMBQ14956 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPNMBQ14956 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
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