Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA3AQ14563 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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