Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIM25Q14258 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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