Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CIRBPQ14011 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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