Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLF9Q13886 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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