Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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