Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRR1Q13601 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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