Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
PKD2Q13563 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PKD2Q13563 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
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