Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PICALMQ13492 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PICALMQ13492 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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