Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMAD4Q13485 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMAD4Q13485 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMAD4Q13485 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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