Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CDK5R2Q13319 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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CDK5R2Q13319 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK5R2Q13319 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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