Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 219.97■□□□□ 0.794e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.575e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TNNI3-202ENST00000585806 699 ntTSL 221.66■■□□□ 1.065e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TNNI3-208ENST00000589864 525 ntTSL 220.38■□□□□ 0.855e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 PNN-201ENST00000216832 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.048e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.336e-12■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AIMP2-201ENST00000223029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.126e-12■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.246e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.156e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.076e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 BCKDHA-207ENST00000544905 562 ntTSL 212.07□□□□□ -0.486e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AL356299.2-201ENST00000609218 586 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.343e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.892e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.334e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.074e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-205ENST00000473038 948 ntTSL 217.69■□□□□ 0.424e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.344e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-213ENST00000497973 667 ntTSL 213.89□□□□□ -0.194e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-206ENST00000475919 630 ntTSL 213.87□□□□□ -0.194e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-211ENST00000495913 421 ntTSL 312.69□□□□□ -0.384e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 AKR1A1-210ENST00000487654 552 ntTSL 28.81□□□□□ -14e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.661e-10■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 PRMT5-214ENST00000553915 1931 ntTSL 216.86■□□□□ 0.297e-28■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 PRMT5-218ENST00000555454 771 ntTSL 59.78□□□□□ -0.847e-28■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 PRMT5-206ENST00000454731 617 ntTSL 37.8□□□□□ -1.167e-28■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.526e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 STARD10-210ENST00000537947 1100 ntTSL 329.6■■■□□ 2.336e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 KREMEN1-206ENST00000479755 503 ntTSL 415.06■□□□□ 03e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC8.17□□□□□ -1.13e-6■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TMCO1-202ENST00000392129 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.225e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TMCO1-201ENST00000367881 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.525e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 TMCO1-208ENST00000612311 4468 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.895e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.473e-7■■■■□ 24.5
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PABPC4Q13310 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.873e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.993e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.063e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ELF1-203ENST00000498824 3563 ntTSL 24.02□□□□□ -1.771e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.831e-9■■■■□ 24.5
PABPC4Q13310 FBXL5-213ENST00000515679 591 ntTSL 319.67■□□□□ 0.741e-13■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 FBXL5-212ENST00000514541 592 ntTSL 419.67■□□□□ 0.741e-13■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 FBXL5-206ENST00000507899 741 ntTSL 519.67■□□□□ 0.741e-13■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 FBXL5-208ENST00000510802 532 ntTSL 518.63■□□□□ 0.571e-13■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 01e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 24.4
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PABPC4Q13310 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.252e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 DCXR-208ENST00000579004 341 ntTSL 314.54□□□□□ -0.086e-13■■■■□ 24.4
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PABPC4Q13310 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.992e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.992e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 INS-IGF2-201ENST00000356578 1706 ntTSL 520.37■□□□□ 0.852e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-323■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 HBA1-203ENST00000472694 674 ntTSL 1 (best)21.42■■□□□ 1.021e-323■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 HBA1-202ENST00000397797 504 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-323■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.613e-10■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 NDUFV1-220ENST00000531250 736 ntTSL 221.88■■□□□ 1.091e-14■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.685e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.14e-7■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.914e-7■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-206ENST00000473916 2000 ntTSL 220.1■□□□□ 0.812e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-207ENST00000476162 2228 ntTSL 1 (best)17.67■□□□□ 0.422e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.292e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-205ENST00000469358 3429 ntTSL 513.26□□□□□ -0.292e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.432e-8■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 ABHD4-204ENST00000489928 507 ntTSL 315.38■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTK2B-210ENST00000517339 3914 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.633e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.813e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.823e-11■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 24.4
PABPC4Q13310 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 315.82■□□□□ 0.122e-78■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-78■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.642e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.732e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.882e-8■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.36e-14■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 DMPK-210ENST00000596686 2499 ntTSL 222.42■■□□□ 1.184e-6■■■■□ 24.3
PABPC4Q13310 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 24.3
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