Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SRSF6Q13247 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SRSF6Q13247 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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