Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME3Q13232 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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NME3Q13232 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME3Q13232 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME3Q13232 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NME3Q13232 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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