Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SELENBP1Q13228 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SELENBP1Q13228 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms