Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP4Q13115 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUSP4Q13115 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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