Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1BQ13112 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHAF1BQ13112 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms