Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MKRN3Q13064 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN3Q13064 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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