Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFX1Q12986 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFX1Q12986 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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