Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NFIAQ12857 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
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