Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 MRP2YPR166C 348 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 DAL5YJR152W 1632 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 PUF4YGL014W 2667 nt0.81□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 snR76snR76 109 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 MFB1YDR219C 1398 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 APC2YLR127C 2562 nt0.8□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 RRP6YOR001W 2202 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 MMF1YIL051C 438 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 VTI1YMR197C 654 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 DYN3YMR299C 939 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 PRM4YPL156C 855 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 RTG3YBL103C 1461 nt0.79□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 CAF20YOR276W 486 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 AEP3YPL005W 1821 nt0.78□□□□□ -2.28
TY1B-LR1Q12088 VOA1YGR106C 798 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YLR379WYLR379W 375 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YPL035CYPL035C 348 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YPL238CYPL238C 390 nt0.78□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 CRD1YDL142C 852 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 CTK3YML112W 891 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 BST1YFL025C 3090 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 SHS1YDL225W 1656 nt0.77□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 MSS2YDL107W 1056 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 RPL37BYDR500C 267 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 NBL1YHR199C-A 222 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YRO2YBR054W 1035 nt0.76□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 CCL1YPR025C 1182 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YNR066CYNR066C 1311 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 TRM12YML005W 1389 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 MON1YGL124C 1935 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 UBC9YDL064W 474 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YDR355CYDR355C 303 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YER078W-AYER078W-A 165 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 PEX27YOR193W 1131 nt0.75□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 PRK1YIL095W 2433 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 PBP4YDL053C 558 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 UBC5YDR059C 447 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 SNC1YAL030W 354 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YBL029WYBL029W 1131 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 HHT2YNL031C 411 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 PIN3YPR154W 648 nt0.74□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 FMN1YDR236C 657 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YEL028WYEL028W 462 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 GLC7YER133W 939 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 ACB1YGR037C 264 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YJL211CYJL211C 444 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 CPR3YML078W 549 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 BAG7YOR134W 1230 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 ATG5YPL149W 885 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 FUS1YCL027W 1539 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 EST2YLR318W 2655 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 MPD1YOR288C 957 nt0.73□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 BEM3YPL115C 3387 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 HSE1YHL002W 1359 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 ESA1YOR244W 1338 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 BTT1YDR252W 450 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 SPO74YGL170C 1242 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 RGI2YIL057C 495 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 YLR400WYLR400W 474 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 MSS4YDR208W 2340 nt0.72□□□□□ -2.29
TY1B-LR1Q12088 ALY2YJL084C 3141 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 LRS4YDR439W 1044 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YMR31YFR049W 372 nt0.71□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 CKA1YIL035C 1119 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YKL177WYKL177W 339 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 ATP16YDL004W 483 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YER107W-AYER107W-A 321 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 SRL1YOR247W 633 nt0.7□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 SHR3YDL212W 633 nt0.69□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 POL4YCR014C 1749 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 SLF1YDR515W 1344 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 CDC50YCR094W 1176 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YDR018CYDR018C 1191 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 CHC1YGL206C 4962 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 KAP122YGL016W 3246 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 SRN2YLR119W 642 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YBR032WYBR032W 303 nt0.68□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 PPN1YDR452W 2025 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 MNE1YOR350C 1992 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YLR149CYLR149C 2193 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YER189WYER189W 369 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 BIT61YJL058C 1632 nt0.67□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 RNH202YDR279W 1053 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 HLR1YDR528W 1272 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YGR273CYGR273C 525 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YLR444CYLR444C 303 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 PAF1YBR279W 1338 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 ASI3YNL008C 2031 nt0.66□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 SEC63YOR254C 1992 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 ERV14YGL054C 417 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 CLG1YGL215W 1359 nt0.65□□□□□ -2.3
TY1B-LR1Q12088 YDL026WYDL026W 312 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 AIM6YDL237W 1173 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt0.65□□□□□ -2.31
TY1B-LR1Q12088 CIC1YHR052W 1131 nt0.65□□□□□ -2.31
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