Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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SYCNQ0VAF6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SYCNQ0VAF6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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