Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NIPAL4Q0D2K0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPAL4Q0D2K0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms