Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLFN5Q08AF3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLFN5Q08AF3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms