Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE4DQ08499 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE4DQ08499 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms