Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CYP4F3Q08477 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms