Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DHX9Q08211 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DHX9Q08211 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms