Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFF3Q07654 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TFF3Q07654 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms