Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX4Q06945 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX4Q06945 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms