Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RAD51Q06609 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RAD51Q06609 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms