Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNB3Q05901 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNB3Q05901 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms