Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SP4Q02446 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SP4Q02446 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP4Q02446 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP4Q02446 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms