Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDR2Q01850 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms