Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM2Q00987 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM2Q00987 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms