Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDC42EP1Q00587 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDC42EP1Q00587 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms