Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PITPNAQ00169 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PITPNAQ00169 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms