Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTD2P86397 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTD2P86397 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTD2P86397 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HTD2P86397 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
HTD2P86397 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HTD2P86397 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HTD2P86397 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HTD2P86397 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HTD2P86397 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms