Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMF1P82094 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMF1P82094 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMF1P82094 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMF1P82094 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMF1P82094 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMF1P82094 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMF1P82094 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMF1P82094 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMF1P82094 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMF1P82094 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms