Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP2P81877 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP2P81877 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms