Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRX1P78414 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRX1P78414 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRX1P78414 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IRX1P78414 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IRX1P78414 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IRX1P78414 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IRX1P78414 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms