Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX5P78411 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRX5P78411 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRX5P78411 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRX5P78411 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRX5P78411 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRX5P78411 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms