Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTAG1AP78358 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTAG1AP78358 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms