Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPD3P62318 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRPD3P62318 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms