Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UFM1P61960 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UFM1P61960 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
UFM1P61960 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UFM1P61960 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
UFM1P61960 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
UFM1P61960 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
UFM1P61960 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
UFM1P61960 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms