Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VBP1P61758 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VBP1P61758 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VBP1P61758 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VBP1P61758 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms