Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR2FP61218 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms