Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNAP25P60880 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SNAP25P60880 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms